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上周，我看了一个关于“NLP的实践特性工程”的演讲。主要是关于LIME和SHAP在文本分类可解释性方面是如何工作的。

我决定写一篇关于它们的文章，因为它们很有趣、易于使用，而且视觉上很吸引人。

所有的机器学习模型都是在更高的维度上运行的，而不是在人脑可以直接看到的维度上运行的，这些机器学习模型都可以被称为黑盒模型，它可以归结为模型的可解释性。特别是在NLP领域中，特征的维数往往很大，说明特征的重要性变得越来越复杂。

LIME & SHAP不仅帮助我们向最终用户解释NLP模型的工作原理，而且帮助我们自己解释NLP模型是如何工作的。

利用 Stack Overflow 问题标签分类数据集，我们将构建一个多类文本分类模型，然后分别应用LIME和SHAP对模型进行解释。由于我们之前已经做过多次文本分类，所以我们将快速构建NLP模型，并着重于模型的可解释性。

数据预处理、特征工程和逻辑回归

 import pandas as pd
	import numpy as np
	import sklearn
	import sklearn.ensemble
	import sklearn.metrics
	from sklearn.utils import shuffle
	from __future__ import print_function
	from io import StringIO
	import re
	from bs4 import BeautifulSoup
from nltk.corpus import stopwords
	from sklearn.model_selection import train_test_split
	from sklearn.feature_extraction.text import CountVectorizer
	from sklearn.linear_model import LogisticRegression
	from sklearn.metrics import accuracy_score, f1_score, precision_score, recall_score
	import lime
	from lime import lime_text
	from lime.lime_text import LimeTextExplainer
	from sklearn.pipeline import make_pipeline
df = pd.read_csv('stack-overflow-data.csv')
	df = df[pd.notnull(df['tags'])]
	df = df.sample(frac=0.5, random_state=99).reset_index(drop=True)
	df = shuffle(df, random_state=22)
	df = df.reset_index(drop=True)
	df['class_label'] = df['tags'].factorize()[0]
	class_label_df = df[['tags', 'class_label']].drop_duplicates().sort_values('class_label')
	label_to_id = dict(class_label_df.values)
	id_to_label = dict(class_label_df[['class_label', 'tags']].values)
REPLACE_BY_SPACE_RE = re.compile('[/(){}\[\]\|@,;]')
	BAD_SYMBOLS_RE = re.compile('[^0-9a-z #+_]')
	# STOPWORDS = set(stopwords.words('english'))
	
	def clean_text(text):
	 """
	 text: a string
	 
	 return: modified initial string
	 """
text = BeautifulSoup(text, "lxml").text # HTML decoding. BeautifulSoup's text attribute will return a string stripped of any HTML tags and metadata.
	 text = text.lower() # lowercase text
	 text = REPLACE_BY_SPACE_RE.sub(' ', text) # replace REPLACE_BY_SPACE_RE symbols by space in text. substitute the matched string in REPLACE_BY_SPACE_RE with space.
	 text = BAD_SYMBOLS_RE.sub('', text) # remove symbols which are in BAD_SYMBOLS_RE from text. substitute the matched string in BAD_SYMBOLS_RE with nothing. 
	# text = ' '.join(word for word in text.split() if word not in STOPWORDS) # remove stopwors from text
	 return text
df['post'] = df['post'].apply(clean_text)
	
	list_corpus = df["post"].tolist()
	list_labels = df["class_label"].tolist()
	X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(list_corpus, list_labels, test_size=0.2, random_state=40)
	vectorizer = CountVectorizer(analyzer='word',token_pattern=r'\w{1,}', ngram_range=(1, 3), stop_words = 'english', binary=True)
	train_vectors = vectorizer.fit_transform(X_train)
	test_vectors = vectorizer.transform(X_test)
logreg = LogisticRegression(n_jobs=1, C=1e5)
	logreg.fit(train_vectors, y_train)
	pred = logreg.predict(test_vectors)
	accuracy = accuracy_score(y_test, pred)
	precision = precision_score(y_test, pred, average='weighted')
recall = recall_score(y_test, pred, average='weighted')f1 = f1_score(y_test, pred, average='weighted')print("accuracy = %.3f, precision = %.3f, recall = %.3f, f1 = %.3f" % (accuracy, precision, recall, f1))

我们现在目标并不是产生最好的结果。我想尽快进入LIME & SHAP，这就是接下来发生的事情。

用LIME解释文本预测

从现在开始，这是有趣的部分。下面的代码片段主要是从LIME教程中借来的。

c = make_pipeline(vectorizer, logreg)
	class_names=list(df.tags.unique())
	explainer = LimeTextExplainer(class_names=class_names)
idx = 1877
	exp = explainer.explain_instance(X_test[idx], c.predict_proba, num_features=6, labels=[4, 8])
	print('Document id: %d' % idx)
print('Predicted class =', class_names[logreg.predict(test_vectors[idx]).reshape(1,-1)[0,0]])
	print('True class: %s' % class_names[y_test[idx]])

我们在测试集中随机选择一个文档，它恰好是一个标记为sql的文档，我们的模型也预测它是sql。使用这个文档，我们为标签4 (sql)和标签8 (python)生成解释。

print ('Explanation for class %s' % class_names[4])
print ('\n'.join(map(str, exp.as_list(label=4))))

print ('Explanation for class %s' % class_names[8])
print ('\n'.join(map(str, exp.as_list(label=8))))

很明显，这个文档对标签sql有最高的解释。我们还注意到正负号与特定的标签有关，例如单词"sql"对类sql是正的，而对类python是负的，反之亦然。

我们要为这个文档生成2类标签顶部。

exp = explainer.explain_instance(X_test[idx], c.predict_proba, num_features=6, top_labels=2)
print(exp.available_labels())

它给出了sql和python。

exp.show_in_notebook(text=False)

让我来解释一下这种可视化:

1. 对于本文档，词 "sql"对于类sql具有最高的正分数。

2. 我们的模型预测该文档应该标记为sql，其概率为100%。

3. 如果我们从文档中删除word"sql"，我们期望模型预测label sql的概率为100% - 65% = 35%。

4. 另一方面，单词"sql"对于类python是负面的，我们的模型已经了解到单词"range"对于类python有一个小的正面得分。

我们可能想放大并研究类sql的解释，以及文档本身。

exp.show_in_notebook(text=y_test[idx], labels=(4,))

使用SHAP解释文本预测

以下过程是从本教程中学到的。「链接」

from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
	import tensorflow as tf
	from tensorflow.keras.preprocessing import text
	import keras.backend.tensorflow_backend as K
	K.set_session
	import shap
tags_split = [tags.split(',') for tags in df['tags'].values]
	tag_encoder = MultiLabelBinarizer()
	tags_encoded = tag_encoder.fit_transform(tags_split)
	num_tags = len(tags_encoded[0])
	train_size = int(len(df) * .8)
y_train = tags_encoded[: train_size]
	y_test = tags_encoded[train_size:]
class TextPreprocessor(object):
	 def __init__(self, vocab_size):
	 self._vocab_size = vocab_size
	 self._tokenizer = None
	 def create_tokenizer(self, text_list):
	 tokenizer = text.Tokenizer(num_words = self._vocab_size)
	 tokenizer.fit_on_texts(text_list)
	 self._tokenizer = tokenizer
	 def transform_text(self, text_list):
	 text_matrix = self._tokenizer.texts_to_matrix(text_list)
	 return text_matrix
VOCAB_SIZE = 500
	train_post = df['post'].values[: train_size]
	test_post = df['post'].values[train_size: ]
	processor = TextPreprocessor(VOCAB_SIZE)
	processor.create_tokenizer(train_post)
	X_train = processor.transform_text(train_post)
	X_test = processor.transform_text(test_post)
def create_model(vocab_size, num_tags):
	 model = tf.keras.models.Sequential()
	 model.add(tf.keras.layers.Dense(50, input_shape = (VOCAB_SIZE,), activation='relu'))
	 model.add(tf.keras.layers.Dense(25, activation='relu'))
model.add(tf.keras.layers.Dense(num_tags, activation='sigmoid'))
	 model.compile(loss = 'binary_crossentropy', optimizer='adam', metrics = ['accuracy'])
	 return model
 model = create_model(VOCAB_SIZE, num_tags)
	model.fit(X_train, y_train, epochs = 2, batch_size=128, validation_split=0.1)
 print('Eval loss/accuracy:{}'.format(model.evaluate(X_test, y_test, batch_size = 128)))

• 模型训练完成后，我们使用前200个训练文档作为背景数据集进行集成，并创建一个SHAP explainer对象。
• 我们在测试集的子集上获得各个预测的属性值。
• 将索引转换为单词。
• 使用SHAP的summary_plot方法来显示影响模型预测的主要特性。

attrib_data = X_train[:200]
explainer = shap.DeepExplainer(model, attrib_data)
num_explanations = 20
shap_vals = explainer.shap_values(X_test[:num_explanations])
words = processor._tokenizer.word_index
word_lookup = list()
for i in words.keys():
 word_lookup.append(i)
word_lookup = [''] + word_lookup
shap.summary_plot(shap_vals, feature_names=word_lookup, class_names=tag_encoder.classes_)

• 单词"want"是我们模型使用的最大信号词，对类jquery预测贡献最大。
• 单词"php"是我们模型使用的第四大信号词，当然对PHP类贡献最大。
• 另一方面，单词"php"可能对另一个类有负面信号，因为它不太可能在python文档中看到单词"php"。

关于LIME & SHAP的机器学习可解释性，还有很多需要学习的地方。我只介绍了一小部分NLP。其余的可以在Github上找到。NLP-with-Python/LIME_SHAP_StackOverflow.ipynb at master · susanli2016/NLP-with-Python · GitHub